Главный герой, бывший спец агент, живущий в одном мире, а во сне видящий совершенно другой мир. Но что же будет когда равновесие между мирами будет разрушено?
Два члена экипажа были разбужены по команде, данной главным компьютером, потому что они прибыли в заданную точку. Но вот беда! они не могут вспомнить ни куда и зачем прилетели, ни даже собственных имен, а еще по кораблю бродят пришельцы, заданные целью уничтожить все человечество на Земле...
Сэм провел на луне в полном одиночестве целых три года, за две недели до полета домой он знакомится со своим сменщиком, который как брат близнец, похож на него. Или это сказались годы одиночества и у него не все в порядке с психикой, а может, все-таки, на родной Земле что-то случилось, а видео-сообщения из дома ложь?
На Землю упала комета, хвостом повредив земное магнитное поле, из-за этого возникли магнитные бури в разных точках планеты. Ученый Джеймс Мэйфилд заметил странные явления и пытается рассказать об этом чиновникам, но они, как всегда, отказываются его слушать...
Историки в поисках ответа прибегают к древним пророческим книгам. В одной из них сказано, что день, когда небо утонет в океане, погаснет солнце, запылают леса, и от дыма задохнутся все звери и птицы, станет Концом Света. Люди же выживут, только если сумеют найти скрытый в огнедышащей пещере ключ от входа в каменную «Пирамиду Луны». Именно в ней находится спасение для человечества…
Мы узнаем что же было за 20 лет до тех событий, которые происходили в «Halo: Combat Evolved». Космическим Командованием было поручено крейсеру узнать о загадочных раскопках на планете Жатва, которая известна, как место, где состоялся первый контакт с инопланетянами.